Тая, я думаю вы зря обрезали корни, с ними все было нормально. Со временем наружный слой корней - веламен подсыхает и часто имеет несколько сморщенный, нежизнеспособный вид, но это на первый взгляд. Центральная часть корня, называемая тяжем остается живой и нормально функционирует. Только если корень совсем истлел и рассыпается в руках, а тяж имеет темный вид его можно обрезать.
То количество корней, которое сейчас осталось могут не вытянуть столько листьев и они пожелтеют. Все срезы можно было обработать обычной зеленкой и -или обильно присыпать углем или молотой корицей, она обладает антисептическими свойствами.
На первом фото, тоже, ничего страшного мне кажется, нет. Эти пятна сверху или ткань внутри листа поражена?